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Gene Protein Transcript Promoter Expression GO/PPI PubMed Cross reference

Gene information for SF3B1 (Homo sapiens) (Information is obtained from NCBI Gene database)

Entrez gene ID 23451 Official gene symbol SF3B1 Full name splicing factor 3b, subunit 1, 155kDa Aliases ,Hsh155,PRP10,PRPF10,SAP155,SF3b155, Gene summary This gene encodes subunit 1 of the splicing factor 3b protein complex. Splicing factor 3b, together with splicing factor 3a and a 12S RNA unit, forms the U2 small nuclear ribonucleoproteins complex (U2 snRNP). The splicing factor 3b/3a complex binds pre-mRNA upstream of the intron's branch site in a sequence independent manner and may anchor the U2 snRNP to the pre-mRNA. Splicing factor 3b is also a component of the minor U12-type spliceosome. The carboxy-terminal two-thirds of subunit 1 have 22 non-identical, tandem HEAT repeats that form rod-like, helical structures. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq] Location Chromosome: 2   Locus: 2q33.1 Gene position 198299771 - 198256698  Map Viewer Gene orientation minus Gene size 43074 bp Gene sequence >SF3B1:complement(48466116..48509189):Length=43074 GGAAGTTCTTGGGAGCGCCAGTTCCGTCTGTGTGTTCGAGTGGACAAAATGGCGAAGATC GCCAAGACTCACGAAGGTAAGCGGTCTTTCCCTGCTTACGTGTTTTCTTCGTTGCTAGCC TAATAAAAGCCTTTTTTCCTAGGATTCTGCCTTTTTCTATGGTTTCTTTCGTAGGAGCTG AGCCCGCGTTTCGGGGCCAAGGGTCGTCTCCTCCGCGCCAGCGGCGCAGGCCACTGCCCC GCGTAATGGCGTCCTCCTCTTACACCCCCGACAGGCGCTTTGTTCAGTGTTTGGGACCTG CTACTTCAGAGTAGCTTCTCTTCTCTGACCAGAGGGCCTCGTTTAAGCGGCTTCCTCAGT AGGATTCGTGGGCAAGGGATCGGGGAAGCGGGCGTGGGGAGAAGGTCTCACTCGCCTCTC GACACTGTCGTCCCCATAGTTTGTGCAGAAGAGGGTCAGAAAAGCACTGAAATACGGCAG CCGCTTTTCCGGCAGACTGAATCGAATTTGGTTAAACCGAGATTCCGTTACTCCTACCCT TGTGTGTCTTCAAGCGTCAGTTACTTGTTTATTTTTCTTGCACGAAACGATTTGGGGATA AAATCTGGTAGTTGTTTTCCCTCCCTTAGTCACTTTTAGTATAATATTGATCTTTTTCTT TGGAGACTGGTTATTGGAGGAGCAGATGGAAGAGGAAAACATAAATTACTTTCATTAATG 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